Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gpc1Q9QZF2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms