Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rnf11Q9QYK7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf11Q9QYK7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf11Q9QYK7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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