Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nr2e3Q9QXZ7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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