Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Col5a3Q9JLI2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Col5a3Q9JLI2 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Col5a3Q9JLI2 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Col5a3Q9JLI2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Col5a3Q9JLI2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Col5a3Q9JLI2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Col5a3Q9JLI2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Col5a3Q9JLI2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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