Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ldb3Q9JKS4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms