Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trem1Q9JKE2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trem1Q9JKE2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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