Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Scamp5Q9JKD3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms