Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Trim39Q9ESN2 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trim39Q9ESN2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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