Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snap29Q9ERB0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms