Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clstn2Q9ER65 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clstn2Q9ER65 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms