Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Smg9Q9DB90 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Smg9Q9DB90 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Smg9Q9DB90 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Smg9Q9DB90 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Smg9Q9DB90 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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