Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd9Q9D9M4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pdzd9Q9D9M4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pdzd9Q9D9M4 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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