Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp12Q9D9M2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp12Q9D9M2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms