Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gtf3c6Q9D8P7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gtf3c6Q9D8P7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gtf3c6Q9D8P7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gtf3c6Q9D8P7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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