Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem54Q9D7S1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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