Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Echdc3Q9D7J9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Echdc3Q9D7J9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms