Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rnf225Q9D7D1 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf225Q9D7D1 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf225Q9D7D1 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms