Protein–RNA interactions for Protein: Q9D735

Trir, Telomerase RNA component interacting RNase, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrirQ9D735 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TrirQ9D735 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TrirQ9D735 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms