Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nop56Q9D6Z1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nop56Q9D6Z1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms