Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Syce1Q9D495 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Syce1Q9D495 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Syce1Q9D495 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Syce1Q9D495 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms