Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cfap53Q9D439 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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