Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpn3Q9D3W4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms