Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx29Q9D3S3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms