Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms