Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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