Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cnih4Q9CX13 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnih4Q9CX13 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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