Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms