Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg12Q9CQY1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms