Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ergic3Q9CQE7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ergic3Q9CQE7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms