Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Efcab2Q9CQ46 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Efcab2Q9CQ46 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms