Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chmp3Q9CQ10 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms