Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg3Q9CPX6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg3Q9CPX6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms