Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim26Q99PN3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms