Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms