Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms