Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms