Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Cldn16Q925N4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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