Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Smg8Q8VE18 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smg8Q8VE18 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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