Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SrrdQ8K2M3 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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