Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Abcf3Q8K268 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Abcf3Q8K268 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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