Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms