Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SbsnQ8CIT9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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SbsnQ8CIT9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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