Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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