Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Upp2Q8CGR7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms