Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nhlrc3Q8CCH2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Nhlrc3Q8CCH2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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