Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccdc113Q8C5T8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ccdc113Q8C5T8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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