Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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