Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo3Q8C2S7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Amigo3Q8C2S7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Amigo3Q8C2S7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Amigo3Q8C2S7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Amigo3Q8C2S7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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