Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TtpaQ8BWP5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms