Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Usp38Q8BW70 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Usp38Q8BW70 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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